(2011年5月時点で)最新のFFMPEGのソースだとCentOS4標準でついてるgccではコンパイルできないみたいですねー。
試しにgcc32でコンパイルしても無理でした。

common.mak:28: *** 終端がない関数呼び出し `foreach': `)' がありません。中止。
って出ます。
にんともかんとも。

で、適当にググってたら下記が参考になったのでメモとしてリンク。

Linux(CentOSその他)にyum経由でffmpegパッケージをインストールする方法 – Layer8 Reference
http://jp.layer8.sh/reference/entry/show/id/2433