お昼ごろからサーバがまた止まってたっぽいです。
再起動したら直りましたが。
以下、messagesのログ。

: pcscd invoked oom-killer: gfp_mask=0x201d2, order=0,
oomkilladj=0
: [] out_of_memory+0x72/0x1a5
: [] __alloc_pages+0x216/0x297
: [] __do_page_cache_readahead+0xc4/0x1c6
: [] __wake_up_common+0x2f/0x53
: [] dm_any_congested+0x2f/0x35 [dm_mod]
: [] filemap_nopage+0x151/0x314
: [] __handle_mm_fault+0x178/0x8b3
: [] usbdev_read+0x197/0x203
: [] do_page_fault+0x20a/0x4b8
: [] do_page_fault+0x0/0x4b8
: [] error_code+0x39/0x40
: =======================
: Mem-info:
: DMA per-cpu:
: cpu 0 hot: high 0, batch 1 used:0
: cpu 0 cold: high 0, batch 1 used:0
: DMA32 per-cpu: empty
: Normal per-cpu:
: cpu 0 hot: high 90, batch 15 used:9

これは・・・メモリの食いすぎか・・・？
あと、HDDは熱対策のためにサーバ本体から隔離してるけどメモリやCPUはさにあらずな件について。